VERIFIKASI IDENTITAS PRODUK FILET IKAN KAKAP (LUTJANUS SP.) MENTAH MENGGUNAKAN ANALISIS DNA BARCODING DAN DNA MINI-BARCODING BERBASIS GEN COI DI KABUPATEN SLEMAN, KABUPATEN BANTUL, DAN KOTA YOGYAKARTA, DAERAH ISTIMEWA YOGYAKARTA

DELGA BUGIJANGGE (2025) VERIFIKASI IDENTITAS PRODUK FILET IKAN KAKAP (LUTJANUS SP.) MENTAH MENGGUNAKAN ANALISIS DNA BARCODING DAN DNA MINI-BARCODING BERBASIS GEN COI DI KABUPATEN SLEMAN, KABUPATEN BANTUL, DAN KOTA YOGYAKARTA, DAERAH ISTIMEWA YOGYAKARTA. Tugas Akhir thesis, Universitas Kristen Duta Wacana.

	Text (Skripsi Biologi) 31210415_Bab1_Bab5_daftarpustaka.pdf Restricted to Repository staff only until 2 August 2027. Download (8MB) | Request a copy
	Text (Skripsi Biologi) 31210415_Bab2 -sd- Bab4_Lampiran.pdf Restricted to Repository staff only until 2 August 2027. Download (6MB) | Request a copy

Abstract

Verifikasi identitas spesies pada produk perikanan merupakan salah satu langkah penting dalam menjamin keamanan pangan. Penelitian ini bertujuan untuk melihat tingkat keseuaian produk filet ikan kakap mentah yang dijual di Kabupaten Sleman, Kabupaten Bantul, dan Kota Yogyakarta, Daerah Istimewa Yogyakarta. Sampel ikan kakap (Lutjanus sp.) diamplifikasi menggunakan metode DNA barcoding konvensional (~650 bp) dan mini-barcoding (~150–300 bp) berbasis gen Cytochrome c Oxidase Subunit I (COI) pada produk filet mentah di Kabupaten Sleman, Kabupaten Bantul, dan Kota Yogyakarta, Daerah Istimewa Yogyakarta. Sebanyak 10 sampel filet mentah yang berlabel “ikan kakap” dikumpulkan dan diekstraksi menggunakan TIANamp® Genomic DNA Kit (Tiangen Biotech, Beijing, China). Amplifikasi PCR dilakukan menggunakan primer Fish-F2/FishR2 untuk barcoding (~600 bp) dan mlCOlintF/jgHCO2198 untuk mini barcoding (~300 bp). Hasil amplifikasi yang berhasil kemudian disekuensing dan dianalisis menggunakan perangkat lunak MEGA XII untuk penyusunan kontig, penjajaran sekuens, dan konstruksi pohon filogenetik menggunakan metode Neighbor-Joining dengan Model Kimura 2-Parameter. Hasil identifikasi menunjukkan bahwa 6 sampel sesuai dengan label spesies Lutjanus sp., sementara 4 lainnya tidak sesuai. Dua sampel (R-Y1, R-Y6) teridentifikasi sebagai Pristipomoides multidens (famili Lutjanidae, tetapi bukan genus Lutjanus), dua sampel (R-Y7, R-Y12) merupakan Lates sp. dari famili Latidae. Dari 10 sampel yang diuji, hanya satu sampel (R-Y4) berhasil diamplifikasi menggunakan metode DNA barcoding, sedangkan sembilan sampel lainnya hanya dapat diidentifikasi melalui metode DNA mini-barcoding. Temuan ini menunjukan bahwa terdapat ketidaksesuaian label pada sampel ikan filet mentah yang dijual di Yogyakarta dan metode DNA mini-barcoding lebih andal untuk mengamplifikasi sampel filet mentah.

Actions (login required)

View Item